أتوفاكون دواء اصطناعي من فئة هيدروكسي نافثوكينون، يتميز بفعاليته القوية كمضاد للميكروبات. يُستخدم بشكل أساسي لعلاج والوقاية من الالتهاب الرئوي الناجم عن المتكيسة الرئوية الجيروفيسية (PCP) والملاريا. يعمل الدواء عن طريق تثبيط سلسلة نقل الإلكترون في الميتوكوندريا لدى الطفيليات، مما يعطل إنتاج الطاقة لديها. يُعطى أتوفاكون عادةً عن طريق الفم، وعادةً ما يكون جيد التحمل. يُستخدم بشكل شائع مع البروغوانيل للوقاية من الملاريا وعلاجها. يتميز الدواء بنصف عمر طويل، مما يسمح بتحديد جرعات مناسبة. يُعد أتوفاكون فعالاً ضد بعض أنواع العدوى الأولية وبعض أنواع العدوى الانتهازية لدى المرضى الذين يعانون من نقص المناعة. يتحسن امتصاصه عند تناوله مع الأطعمة الدهنية. تشمل الآثار الجانبية الشائعة الغثيان والقيء والطفح الجلدي، على الرغم من ندرة حدوث ردود فعل خطيرة. بشكل عام، يُعد أتوفاكون عاملاً مهماً مضاداً للميكروبات في كل من الوقاية والعلاج.