L'aminotrifluorométhyle est principalement utilisé en chimie médicinale. Il comprend des composés tels que la 4-(trifluorométhyl)aniline, la 3-(trifluorométhyl)aniline, la 7-amino-4-(trifluorométhyl)coumarine et le 2-amino-5-trifluorométhyl-1,3,4-thiadiazole.