يُستخدم أمينو تريفلوروميثيل بشكل رئيسي في الكيمياء الطبية. ويحتوي على مركبات مثل 4-(ثلاثي فلورو ميثيل) أنيلين، و3-(ثلاثي فلورو ميثيل) أنيلين، و7-أمينو-4-(ثلاثي فلورو ميثيل) كومارين، و2-أمينو-5-ثلاثي فلورو ميثيل-1،3،4-ثياديازول.